CHKBiotech успішно розробила набір для виявлення нових варіантів коронавірусу

Новий варіант коронавірусу, штам 501Y-V2 з Південної Африки
18 грудня 2020 року в Південній Африці виявили мутант 501Y-V2 нового коронавірусу.Зараз південноафриканський мутант поширився більш ніж в 20 країнах.Експерименти показали, що вищезгадані нові мутанти коронавірусу можуть нести інші варіанти нового коронавірусу мутацій K417N/T, E484K і N501Y, які можуть зменшити нейтралізуючу здатність індукованих вакциною нейтралізуючих антитіл плазми.Однак у порівнянні з еталонним геномом Wuh01 (номер послідовності MN908947), 501Y.V2 послідовності південноафриканського мутантного геному має 23 варіанти нуклеотидів.Він має ту саму мутацію N501Y, що й британський мутант підтипу B.1.1.7, але все ще містить мутації в двох ключових сайтах E484K і K417N білка S, які мають потенційно важливий вплив на здатність вірусу заражати.

Новий коронавірус є одноланцюговим РНК-вірусом, мутації генома якого є більш частими.Виявлення однієї цілі може легко призвести до пропуску виявлення зразків із низьким вірусним навантаженням і мутованими штамами вірусу.Частота повторного обстеження при одноразовому позитивному виявленні цілі може досягати більше 10%, що може збільшити навантаження та подовжити час діагностики.Виявлення кількох цілей і взаємна перевірка результатів кожної цілі можуть збільшити швидкість виявлення та полегшити ранню діагностику.

новини1

Малюнок 1. Принципова схема механізму зараження новим коронавірусом

Новий коронавірусний мутант B.1.1.7 з Британії
26 грудня 2020 року перша наукова стаття про штам B.1.1.7 була опублікована онлайн.Інститут гігієни Лондонського університету Великобританії та тропічних хвороб підтвердив, що штам B.1.1.7 є більш здатним до поширення, ніж інші штами, що становить понад 56% (95% ДІ 50-74%).Оскільки цей новий мутантний штам має більш очевидну потужність передачі, контролювати COVID-19 стало важче.Наступного дня Бірмінгемський університет у Великій Британії завантажив статтю на MedRxiv.Дослідження показало, що кількість копій генів вірусу ORF1ab і N у пацієнтів, інфікованих мутантним штамом B.1.1.7 (відпадання S-гену), була значно збільшена;це явище спостерігалося серед населення.У цій статті вказується, що пацієнти, інфіковані британським мутантом B.1.1.7, мають значно вище вірусне навантаження, тому цей мутант також може бути більш патогенним.

1

Рисунок 2. Послідовність геномної мутації, що міститься в мутантному штамі коронавірусу B.1.1.7 з Британії

2

Рисунок 3. Мутація N501Y виникла як у Великобританії, так і в Південній АфриціВаріанти

Набір для виявлення нових варіантів коронавірусу
Компанія Chuangkun Biotech Inc. успішно розробила набір для виявлення нових варіантів коронавірусу B.1.1.7 і 501Y-V2.

Переваги цього продукту: висока чутливість, одночасне виявлення 4 мішеней, охоплюючи основні сайти мутації мутантного штаму B.1.1.7 і південноафриканського мутантного штаму 501Y.V2.Цей набір може одночасно виявляти сайти мутації N501Y, HV69-70del, E484K і новий ген S коронавірусу;Швидкий тест: від взяття зразка до результату потрібно лише 1 година 30 хвилин.

3

Рисунок 4. Виявлення кривої ампліфікації варіанту COVID-19 у Британії

4

Рисунок 5. Крива ампліфікації південноафриканського варіанту виявлення COVID-19

5

Рисунок 6. Крива ампліфікації нового коронавірусу дикого типу

Незрозуміло, як ці мутації накопичують новий довгостроковий вплив пандемії COVID-19.Але це нагадує нам, що ці мутації можуть вплинути на ефективність природного імунітету та імунітету, викликаного вакцинацією.Це також нагадує нам, що нам потрібно постійно стежити за новим коронавірусом протягом тривалого часу та оновлювати вакцину проти COVID-19, щоб впоратися з еволюцією нового коронавірусу.


Час публікації: 12 березня 2021 р